A clorexidina é uma bisbiguanida de amplo espectro que age em bactérias gram-positivas, gram-negativas, alguns vírus, leveduras e fungos. É considerada o agente químico gold standard no controle do biofilme supragengival e da inflamação e vem sendo utilizada como terapia coadjuvante em Periodontia desde a década de 1970. A literatura ao longo desse tempo vem propondo indicações, protocolos, formulações e concentrações distintas, podendo gerar dúvidas quanto asua prescrição. Esta revisão teve como objetivo abordar a literatura científica com intuito de auxiliar o decision making do periodontista quanto ao uso da clorexidina frente ao tipo de doença, perfil sistêmico e limitações de cada paciente.